第一步：系统安装、注册及初始化
安装ISOMIS，在互联网上注册后即可使用。虽然不带任何模板也可以使用，但仍建议用户在初始化前先挑选适合的模板，这样会更加快速进入符合客户具体情况的应用。模型选择、改造、客户化工作流程如[应用ISOMIS业务基础平台开发管理信息系统过程]。
第二步：权限设定及数据定义
当系统建立完成后，即可参照操作手册进行组织架构、系统权限和初始数据的定义。该过程可由服务方完成，也可以由用户自行完成。
第三步：文档建立
当系统设定完成之后，如用户已通过ISO9000认证，即可将本单位的ISO9000质量体系文件输入并建立相关的质量记录，如用户正在准备通过ISO9000认证，可在ISOMIS平台下进行。
上述工作是管理体系（管理模型）的基本定义工作。
第四步：操作培训
当文档建立后或者在文档建立过程中，用户应对所有操作者和相关人员进行使用培训，使其能够熟练使用系统完成工作，保证系统得以良好运用，保护您的投资，也是对我们付出心血最好的回报。
第五步：应用及反馈
当您使用系统中发现问题和有不明白之处，以即您对我们有什么改进建议，请及时和直接的服务商或我们联系，您将会得到满意的答复，这也是对我们不断发展与进步最好的支持。